Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms