Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms