Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRHP20396 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRHP20396 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRHP20396 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRHP20396 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRHP20396 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
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