Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGCP20142 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGCP20142 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGCP20142 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms