Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDSP20132 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDSP20132 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDSP20132 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDSP20132 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDSP20132 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDSP20132 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDSP20132 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDSP20132 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms