Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRAP18433 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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