Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAV1P15498 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAV1P15498 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms