Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFTRP13569 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFTRP13569 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFTRP13569 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFTRP13569 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms