Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRP12270 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPRP12270 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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