Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB1P11230 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms