Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD8BP10966 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms