Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI3P10071 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLI3P10071 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLI3P10071 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms