Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF3P09919 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms