Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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