Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms