Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFLP07196 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFLP07196 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFLP07196 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFLP07196 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEFLP07196 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms