Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA4P06727 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOA4P06727 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOA4P06727 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOA4P06727 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOA4P06727 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA4P06727 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA4P06727 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms