Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB2P05107 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms