Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRMUO75648 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms