Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKAP2O75563 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms