Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms