Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNSO60931 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms