Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLIN1O60240 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms