Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms