Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE40O14503 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms