Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms