Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms