Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF25A6NGN4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PRAMEF25A6NGN4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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