Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC35F4A4IF30 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC35F4A4IF30 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms