Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT52Q9Y366 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms