Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms