Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms