Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms