Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFDP1Q9UEE9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms