Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms