Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms