Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRFN1Q9P244 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms