Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms