Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIS18AQ9NYP9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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MIS18AQ9NYP9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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MIS18AQ9NYP9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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MIS18AQ9NYP9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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MIS18AQ9NYP9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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MIS18AQ9NYP9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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MIS18AQ9NYP9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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