Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RLIMQ9NVW2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms