Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms