Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms