Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EMILIN3Q9NT22 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms