Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms