Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms