Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms