Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms