Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRN3Q9H3W5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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