Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASXL3Q9C0F0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms