Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357093.1-201ENST00000556926 458 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms